Nació en Biarritz el 8 de agosto de 1868, era hijo de Juan Vicente de Aragón y Antentas, Conde de Fuentes (Zaragoza, 15.04.1829-Biarritz, 26.05.1880) y María Cristina Padilla y Laborda, (Sevilla, 29.04.1830-Biarritz, 03.04.1901). Su familia tenía Grandeza de España y le legaron una sólida posición social. 

De formación castrense, su vida profesional estuvo siempre vinculada al ejército. Ingresó en la Academia General del Ejército en 1888 en el arma de caballería y terminó su formación en 1894. Su primer destino fue el escuadrón expedicionario de la princesa. En 1895 obtuvo el grado de primer teniente, un año después ascendió al grado de capitán. Formó parte de la Comisión liquidadora del Regimiento de Numancia, afecta a los Húsares de la princesa. En 1907 con el grado de Capitán de Caballería fue gratificado por su efectividad y se destinó al octavo depósito de reserva. 

Su carrera militar fue en ascenso, en 1922 con el grado de Coronel de Caballería fue destinado al Regimiento de Reserva de Zaragoza. Ascendió a General de Brigada en junio de 1930. Desempeñó el cargo de segundo jefe del Gobierno Militar de Cartagena, del que fue cesado el 27 de abril de 1931 por el Presidente del Gobierno Provisional de la República. 

 Contrajo matrimonio el 5 de mayo de 1901 con María Victoria de Lanny Avilés [Cienfuegos (Cuba), 1878-Madrid, 03.09.1941]. Tuvieron cuatro hijos: Procopio, Pedro Héctor, Sosthenes y Victoria Pignatelli de Aragón y de Lanny.

Heredó el título de conde de Fuentes, con grandeza de España, el 12 de marzo de 1931 el rey Alfonso XIII firmó la rehabilitación del título de conde de Fuentes. Fue Príncipe de Sacro Romano Imperio, y Grande de España. Recibió la condecoración de la Gran Cruz de San Hermenegildo.

            Su participación en la vida política fue coyuntural. Estuvo vinculado al conservadurismo, como seguidor de Antonio Maura se afilió al partido maurista. 

Se retiró de la vida política y con el estallido de la guerra civil, fue detenido el 17 de agosto de 1936 y procesado por el delito de desafección al régimen y encarcelado en la prisión del duque de Sesto. Allí permaneció hasta  que se incoó expediente el 13 de enero de 1937 siendo juzgado por los jurados populares. Según consta en el expediente de la Causa General fue detenido en su domicilio en la calle del Prado. Procopio Pignatelli declaró que se había retirado de la vida militar en 1932, que un año antes había frecuentado los locales de la agrupación Renovación Española pero que no estaba afiliado y que con la llegada de la República se puso al lado del régimen, contaba entonces con 69 años y su estancia en la cárcel empeoró su salud. 

Falleció el 5 de mayo de 1937 en el sanatorio de la calle de Francisco Silvela de Madrid. Fue absuelto de los cargos.

Elecciones y actividad parlamentaria

En las elecciones generales a diputados a Cortes de 1907 fue encasillado por la provincia de Almería, para representar al distrito electoral de Vélez Rubio. 

            Este Distrito electoral había sido tradicionalmente un feudo liberal bajo la representación de Agustín de la Serna, barón de Sacro Lirio. El viejo cacique liberal contaba con un sólido entramado clientelar y desde el partido se preparó el relevo en la persona del periodista madrileño Luis López Ballesteros, director del diario “El Imparcia”l. El encasillado del conservador Procopio Pignatelli originó una dura contienda electoral. El militar tuvo la fuerte oposición de las fuerzas liberales del distrito encabezadas por el diputado provincial Vicente Mena. No obstante, Procopio Pignatelli tuvo los apoyos de los hermanos Fernández López, jefes del Partido Conservador en Vélez Rubio, creadores de un periódico de signo político maurista “El Distrito” que actuaba como órgano de difusión y propaganda. 

            La competencia electoral con su contrincante Luis López Ballesteros se convirtió en una cuestión de honor. Se formó un Tribunal de honor presidido por el duque de Tetuán, que reunido el 5 de diciembre de 1909 acordó que dirimieran sus diferencias sin trabas. Se cumplieron así los trámites protocolarios de un duelo entre ambos contendientes políticos, se retaron a un duelo con sables italianos que tuvo lugar al día siguiente en el teatro de la princesa en un duelo. La prensa comentaba los pormenores del duelo en el que fue herido Luis López Ballesteros. 

            Siendo diputado a Cortes se opuso a las resoluciones del Gobierno Moret nombrado en diciembre de 1909. Procopio Pignatelli se oponía a los ascensos por méritos de guerra en Melilla y prefería que se respetara la antigüedad. El reconocimiento de la primera modalidad por el Gobierno Moret provocó quejas de oficiales. Su protesta fue contestada por el gobierno con su detención. A pesar de su condición de diputado el entonces Ministro de Guerra, el general Luque ordenó su arresto y fue enviado a la prisión de Alicante.